Trường Y Dược, Đại học Đà Nẵng được thành lập trên cơ sở Khoa Y - Dược thuộc Đại học Đà Nẵng; trong cuộc hành trình nhiều khó khăn thử thách hơn 17 năm qua, nhiều thế hệ cán bộ, giảng viên và sinh viên nhà trường đã không ngừng nỗ lực trong quản trị, giảng dạy và học tập để đưa Khoa Y - Dược trở thành một Trường thuộc Đại học Đà Nẵng.

Năm 2007, Lãnh đạo Thành ủy, Ủy ban nhân dân Tp Đà Nẵng, Đại học Đà Nẵng nhận thấy tầm quan trọng phải thành lập, xây dựng và phát triển một cơ sở đào tạo lĩnh vực y tế trên địa bàn thành phố Đà Nẵng. Vào ngày 16/3/2007, được sự đồng ý của Bộ Giáo dục & Đào tạo, Bộ Y tế và Thành ủy Đà Nẵng, Đại học Đà Nẵng quyết định thành lập Khoa Y- Dược. Lúc này, Khoa có chức năng đào tạo, bồi dưỡng cán bộ y tế đồng thời là trung tâm nghiên cứu khoa học sức khỏe và triển khai công nghệ tiên tiến phục vụ yêu cầu phát triển nguồn nhân lực y tế cho thành phố Đà Nẵng và các tỉnh miền Trung - Tây Nguyên. Với sứ mạng lớn lao, nhưng nguồn nhân lực, cơ sở vật chất hạn chế, non trẻ nhiều mặt; năm 2008, Đại học Đà Nẵng đã thỏa thuận liên kết với Đại học Y Dược Tp Hồ Chí Minh cùng Bệnh viện C Đà Nẵng, Bệnh viện Đà Nẵng tuyển sinh đào tạo 02 ngành trình độ đại học chính quy là Y khoa và Dược học. Đến năm 2013, 2014 tuyển sinh đào tạo liên thông chính quy ngành Y khoa cho vùng cao hai tỉnh Quảng Nam và Quảng Ngãi.

Để duy trì và phát triển Khoa, ngoài việc liên kết đào tạo đại học, liên thông chính quy, Khoa mở thêm 02 ngành Điều dưỡng và Dược sĩ trung cấp.

Từ năm 2013, bằng nội lực và sự phối hợp tích cực từ các bệnh viện trên địa bàn thành phố Đà Nẵng cùng sự chỉ đạo quyết liệt, đầu tư cơ sở vật chất của Đại học Đà Nẵng, Khoa chính thức tuyển sinh lần lượt và đào tạo trình độ đại học chính quy các ngành Điều dưỡng, Y khoa, Dược sĩ, Răng - Hàm - Mặt, Kỹ thuật Xét nghiệm y học. Chính nhờ sự nỗ lực của đội ngũ cán bộ viên chức Khoa Y - Dược cùng sự quan tâm của lãnh đạo và các ban chức năng Đại học Đà Nẵng, sự phối hợp chặt chẽ của các bệnh viện, cơ sở thực hành, năm 2017 khóa Cử nhân Điều dưỡng đầu tiên ra trường, đến năm 2020 khóa Bác sĩ đa khoa đầu tiên tốt nghiệp và lần lượt các khóa Dược sĩ và Bác sĩ Răng - Hàm - Mặt tốt nghiệp trong các năm tiếp theo.

Ngày 02/5/2024, được sự đồng ý của Bộ Giáo dục & Đào tạo, Hội đồng Đại học Đà Nẵng ra Nghị quyết thành lập Trường Y Dược thuộc Đại học Đà Nẵng, đánh dấu mốc son lớn, mở ra một trang sử mới với tinh thần đổi mới, hội nhập và phát triển, đồng thời khẳng định vị thế của một học hiệu uy tín, chất lượng ở khu vực miền Trung - Tây Nguyên và cả nước, góp phần vào chiến lược phát triển Đại học Đà Nẵng trở thành Đại học Quốc gia.